کلود مدلهای زیستمولکولی رو ۴ برابر سریعتر کرد
خلاصهٔ کاملتر
آنتروپیک تو پست جدیدش نوشته که کلود، تو قالب Claude Science، بیشتر از ۳۰ مدل یادگیری عمیق متنباز حوزه زیستشناسی رو تو کمتر از چهار هفته بهینه کرده. این مدلها کارهایی مثل پیشبینی ساختار پروتئین (یعنی حدس زدن شکل سهبعدی پروتئین فقط از روی رشته اسیدهای آمینهش) و طراحی پروتئین رو انجام میدن. نتیجه بهطور میانگین حدود ۴ برابر سرعت بیشتر با افت دقت خیلی کم بوده، و نزدیک ۲ برابر با خروجی کاملاً یکسان.
گلوگاه اصلی این مدلها دو عملیات triangle attention و triangle multiplication ـه که هندسه سیستمهای زیستمولکولی رو مدل میکنن. هزینهشون مکعبیه، یعنی دو برابر کردن اندازه سیستم ۸ برابر زمان و حافظه میخواد. کلود براشون یه مجموعه کرنل به اسم FlashPairformer نوشته (کرنل یعنی کد سطحپایینی که مستقیم روی GPU اجرا میشه) که به گفته آنتروپیک روی triangle attention ۲.۷ تا ۲.۹ برابر و روی triangle multiplication ۱.۷ تا ۳.۲ برابر از cuEquivariance، استاندارد فعلی این حوزه، جلو زده.
بخش دوم کار حافظه بوده. کلود یه حالت کممصرف به اسم Big ساخته که فقط با یک نود GPU انویدیا میتونه سیستمهای بزرگتر از ۱۰ هزار توکن رو درست مدل کنه؛ چیزی که قبلاً چند نود میخواست. کمپلکس I میتوکندری انسان، کمپلکس چپرون TRiC، پروتئازوم و ریبوزوم باکتریایی با همین حالت پیشبینی شدن و ساختارشون به چیزی که تو آزمایشگاه اندازهگیری شده نزدیک بود. برای مقایسه، ریبوزوم 40S که AlphaFold3 درست پیشبینی کرده بود ۷۶۶۳ توکن داشت.
تو پست اومده که با همین مدلهای شتابدادهشده، یه کلود تکی با یک کارت H200 و ۲۴ ساعت وقت تونسته تو طراحی بایندرهای پروتئینی به همون کیفیتی برسه که قبلاً با حدود ۱۰ هزار دلار GPU برای هر هدف به دست اومده بود، این بار با حدود ۱۵۰ دلار هزینه کل. همه کدها متنباز شده و آنتروپیک با Adaptyv Bio یه مسابقه طراحی پروتئین راه انداخته با تا ۱ میلیون دلار اعتبار Claude و اعتبارسنجی آزمایشگاهی بیش از ۵۰۰۰ طرح.
نکات کلیدی:
- بیش از ۳۰ مدل متنباز زیستمولکولی تو کمتر از چهار هفته بهینه شدن، میانگین ۴ برابر سریعتر
- کرنل FlashPairformer روی triangle attention تا ۲.۹ برابر از cuEquivariance سریعتره
- حالت Big مدلسازی سیستمهای بالای ۱۰ هزار توکن رو روی یک نود GPU ممکن کرده
- طراحی بایندر با حدود ۱۵۰ دلار به کیفیت کمپین ۱۰ هزار دلاری قبلی رسیده
- مسابقه با Adaptyv Bio: تا ۱ میلیون دلار اعتبار Claude و ۲۵۰ هزار دلار اعتبار Modal




